muitas vezes, quando atualizamos uma distribuição do linux, os kernels anteriores continuam instalados. para remover o kernel anterior do linux, faça o seguinte: (vou tomar como exemplo o ubuntu)
sudo apt-get remove linux-image-2.6.24-16-generic
sudo apt-get remove linux-image-2.6.24-17-generic
isso vai liberar no mínimo 200 megas de espaço no seu disco.
logo logo postarei mais dicas!